Periodos del Covid-19





Periodos del Covid-19 para fallecidos

Nuestra hipótesis se basa principalmente sobre los datos de números de fallecidos y de UCI en Cataluña y Igualada que ha dado la Generalitat cada día en sus comunicats.
https://canalsalut.gencat.cat/ca/salut-a-z/c/coronavirus-2019-ncov/notes-premsa/

A parte de la repartición de los casos en el tiempo, es importante conocer el momento previsto por los estudios científicos en que la curva de fallecidos asciende rápidamente después de un contagio masivo.
Intentemos ver si cuadra con nuestra hipótesis que se basa primero en la detección de un pico fuerte de muertes el 17 de marzo, 17 días después de la manifestación.
... y cuadra perfectamente!

Según los datos de los estudios, 17 días después del contagio, las muertes suben de golpe.

El efecto pico

Nuestra hipótesis es que, el 17 de marzo, se sumaron 2 subidas de fallecidos para reforzar el efecto pico:

• Manifestantes del 29-F entre 65 y 75 años contagiados el 29 de febrero: subida de fallecimientos a los 17 días

• Parientes (en geriátricos) de mas de 80 años contaminados por manifestantes entre el 3 y 7 de marzo y que fallecen 13 días más tarde. Entonces empiezan también a fallecer de forma importante el 17 de marzo.



Análisis detallada

Todos los datos y modelos de periodos para usar en simulaciones, están en Open-source en Github:
CatCovid_Data/Covid19-Periods

Como nuestra base de análisis son los fallecidos, hemos buscado principalmente:
Estudios científicos sobre fallecidos por edades

Así, nos permite calcular el periodo entre un contagio masivo, como nuestra hipótesis de la manifestación del 29-F en Perpiñán, y sus efectos unos días mas tarde (17 días, después de analizar estudios) en los números dados por la Generalitat.
Estos datos y periodos son mas cortos para los fallecidos (más débiles, non-survivor), que los periodos dados en general para todos los enfermos (95 a 99% sobreviven, survivor + non-survivor)

infection-to-death_65-75

(Periodo del contagio al deceso, para gente entre 65 y 75 años)
Subida : 17 dias
Media : 23 dias
Fin : 43 dias

Esta curva, la mas importante, es el resultado de la multiplicación de la repartición de infection-to-symptom por la repartición de symptom-to-death.



La misma curva, con las muertes acumuladas a lo largo de los días. Por 100 personas contagiadas el día 0 y que van a morir, 50 habrán muerto entre 15 y 23,5 días.
Es la misma representación en logaritmo que utilizamos para visualizar la curva de fallecidos de Cataluña.


infection-to-infection

(Periodo de contagio a contagio, independiente de la edad)
Diversos estudios apuntan que la repartición en el tiempo para contagiar a otra persona es similar a la repartición para desarrollar síntomas. Utilizamos la misma curva.

infection-to-symptom

(Periodo de contagio a síntomas, independiente de la edad)
Subida : 3 dias
Media : 5,1 dias
Fin : 14 dias
(independiente de la edad. pocos casos pueden aparecer después de 14 días)

La gran mayoría de los estudios apuntan una media de 5,1 días para desarrollar síntomas después de ser contagiado.
Pero el dato que nos interesa mas, es que la curva asciende fuerte a los 3 días. Significa que, a los 3 días, hay una explosion de muchos nuevos casos sintomáticos.
Esta curva es la repartición en % de sintomáticos por día del Estudio siguiente:
annals.org/incubation-period FIGURE 2.


symptom-to-death_65-75

(Periodo de síntomas a muerte para gente entre 65 y 75 años)
Subida : 14 dias
Media : 18,5 dias
Fin : 29 dias

Un estudio de 'The Lancet' es particularmente interesante porque analiza un grupo de:
54 personas fallecidas, que calificamos de 65 a 75 años.
Realmente, es una repartición estadística de '69·0 (63·0–76·0)', pero da algo muy similar al rango 65-75.
En una tabla, columna 2, penultimo dato, da una indication para este grupo de 54 fallecidos (Time from illness onset to death or discharge), y fija una repartición de los fallecidos en un : Interquartile Range (IQR) of 18,5 (15,0–22,0)
Un otro estudio Japones, pagina 4, sobre un panel de pacientes chino fija también la forma de la curva de fallecidos.
Como apuntado en muchos estudios, la curva no es simétrica, sino que tiene una fuerte subida unos días antes del punto medio, y luego decrece sobre un largo periodo. Pero mantiene la repartición IQR

Obtenemos esta repartición, con un IQR de 18,5 (15,0–22,0)
Vemos que la curva de fallecidos asciende rápidamente 14 días después de desarrollar síntomas.


symptom-to-death_ otras-edades

A la espera de encontrar mas datos precisos sobre otros grupos de edades, hemos decidido proceder a un interpolación que se apoya sobre este dato del articulo The Lancet.
'We found increasing odds of in-hospital death associated with older age (odds ratio 1·10, 95% CI 1·03–1·17; p=0·0043)'.
Aplicando este factor en los cálculos, hemos obtenido un desplazamiento de la repartición para otros grupos respecto a nuestra referencia científica del grupo 65-75:

75-85 años :  -2 días
85-95 años :  -4 días
55-65 años :  +3 días

De momento, es suficiente para nuestra hipótesis, dado que hemos confirmado un periodo de 17 días entre el contagio y la subida de fallecimientos para la categoría de edades que nos interesa.

Numerosos estudios apuntan a un periodo mucho más corto para personas > 80 años.
El panel del estudio japonés es más corto de 2 días y comporta gente de edades más avanzada.

Por ejemplo, este comunicat de Gencat del 09 de març, apunta que una señora de 88 falleció en 3 días de UCI  y uno de 97 años en  1 día en UCI. Mucho más corto que el grupo del estudio de 63 a 76 años.
canalsalut-383791

symptom-to-ICU

(Periodo de síntomas a ingresar en Unidad de Cuidado Intensivo, de momento para gente entre 65 y 75 años)
Subida : 7 dias
Media : 11 dias
Fin : 26 dias

En el estudio Lancet, la misma tabla, columna 2, 4 dato desde abajo, da una indication para un grupo de 39 fallecidos (Time from illness onset to ICU admission), y fija una repartición de los fallecidos en un : Interquartile Range (IQR) of 12·0 (8·0–15·0)
Es decir, la repartición es un poquito más compacta que symptom-to-death, y ocurre 6,5 días antes
Obtenemos una repartición symptom-to-ICU

infection-to-ICU

(Periodo de contagio a ingresar en Unidad de Cuidado Intensivo, de momento independiente de la edad)
Subida : 10 dias
Media : 15 dias
Fin : 29 dias

Resultado de la multiplicación de la repartición de infection-to-symptom por la repartición de symptom-to-ICU
Vemos que la curva de ICU asciende rápidamente 10 días después de desarrollar síntomas.